Protein–RNA interactions for Protein: Q61194

Pik3c2a, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2aQ61194 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pik3c2aQ61194 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pik3c2aQ61194 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pik3c2aQ61194 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Pik3c2aQ61194 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pik3c2aQ61194 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pik3c2aQ61194 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pik3c2aQ61194 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pik3c2aQ61194 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms