Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms