Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
5730522E02RikQ5SP45 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5730522E02RikQ5SP45 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms