Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WhammQ571B6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WhammQ571B6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WhammQ571B6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WhammQ571B6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
WhammQ571B6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WhammQ571B6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WhammQ571B6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WhammQ571B6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
WhammQ571B6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
WhammQ571B6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WhammQ571B6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WhammQ571B6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
WhammQ571B6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WhammQ571B6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
WhammQ571B6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WhammQ571B6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WhammQ571B6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WhammQ571B6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WhammQ571B6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WhammQ571B6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WhammQ571B6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
WhammQ571B6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
WhammQ571B6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
WhammQ571B6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
WhammQ571B6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
WhammQ571B6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
WhammQ571B6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
WhammQ571B6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms