Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmtc2Q56A06 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms