Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SfswapQ3USH5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SfswapQ3USH5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SfswapQ3USH5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfswapQ3USH5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms