Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM28Q13263 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM28Q13263 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
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