Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms