Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms