Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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