Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cct3P80318 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cct3P80318 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cct3P80318 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cct3P80318 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cct3P80318 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cct3P80318 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cct3P80318 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct3P80318 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct3P80318 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct3P80318 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct3P80318 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct3P80318 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct3P80318 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct3P80318 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct3P80318 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct3P80318 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct3P80318 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct3P80318 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct3P80318 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct3P80318 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct3P80318 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct3P80318 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct3P80318 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct3P80318 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct3P80318 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct3P80318 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct3P80318 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct3P80318 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct3P80318 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct3P80318 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct3P80318 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct3P80318 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct3P80318 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms