Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP1P59025 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP1P59025 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP1P59025 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP1P59025 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP1P59025 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP1P59025 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP1P59025 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP1P59025 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP1P59025 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP1P59025 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP1P59025 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP1P59025 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP1P59025 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP1P59025 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP1P59025 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP1P59025 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP1P59025 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP1P59025 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP1P59025 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP1P59025 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP1P59025 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP1P59025 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP1P59025 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP1P59025 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP1P59025 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP1P59025 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP1P59025 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP1P59025 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP1P59025 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP1P59025 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP1P59025 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP1P59025 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP1P59025 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP1P59025 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP1P59025 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP1P59025 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP1P59025 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP1P59025 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP1P59025 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP1P59025 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP1P59025 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP1P59025 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP1P59025 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP1P59025 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP1P59025 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP1P59025 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP1P59025 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP1P59025 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP1P59025 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP1P59025 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP1P59025 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP1P59025 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP1P59025 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP1P59025 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP1P59025 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP1P59025 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP1P59025 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP1P59025 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP1P59025 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP1P59025 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP1P59025 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP1P59025 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP1P59025 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP1P59025 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP1P59025 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP1P59025 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP1P59025 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTP1P59025 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTP1P59025 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RTP1P59025 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTP1P59025 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RTP1P59025 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTP1P59025 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTP1P59025 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTP1P59025 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTP1P59025 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTP1P59025 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP1P59025 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP1P59025 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP1P59025 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP1P59025 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP1P59025 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP1P59025 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP1P59025 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP1P59025 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP1P59025 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP1P59025 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP1P59025 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP1P59025 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP1P59025 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP1P59025 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP1P59025 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP1P59025 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP1P59025 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP1P59025 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP1P59025 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP1P59025 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP1P59025 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP1P59025 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms