Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 204.5 ms