Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox5P52651 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox5P52651 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox5P52651 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox5P52651 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox5P52651 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox5P52651 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox5P52651 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox5P52651 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox5P52651 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox5P52651 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox5P52651 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox5P52651 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox5P52651 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox5P52651 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms