Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Upp1P52624 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Upp1P52624 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Upp1P52624 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upp1P52624 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upp1P52624 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Upp1P52624 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Upp1P52624 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Upp1P52624 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Upp1P52624 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Upp1P52624 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Upp1P52624 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Upp1P52624 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms