Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psen1P49769 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psen1P49769 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psen1P49769 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psen1P49769 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psen1P49769 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Psen1P49769 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psen1P49769 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psen1P49769 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psen1P49769 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psen1P49769 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psen1P49769 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psen1P49769 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Psen1P49769 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms