Protein–RNA interactions for Protein: P49682

CXCR3, C-X-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR3P49682 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR3P49682 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms