Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TfamP40630 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TfamP40630 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TfamP40630 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TfamP40630 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TfamP40630 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TfamP40630 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TfamP40630 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TfamP40630 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TfamP40630 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TfamP40630 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TfamP40630 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TfamP40630 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TfamP40630 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TfamP40630 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TfamP40630 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TfamP40630 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TfamP40630 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TfamP40630 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TfamP40630 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TfamP40630 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TfamP40630 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TfamP40630 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TfamP40630 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TfamP40630 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TfamP40630 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TfamP40630 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TfamP40630 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TfamP40630 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TfamP40630 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TfamP40630 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TfamP40630 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TfamP40630 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TfamP40630 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TfamP40630 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TfamP40630 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TfamP40630 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TfamP40630 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TfamP40630 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TfamP40630 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TfamP40630 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TfamP40630 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TfamP40630 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TfamP40630 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TfamP40630 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TfamP40630 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TfamP40630 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TfamP40630 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TfamP40630 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TfamP40630 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TfamP40630 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TfamP40630 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TfamP40630 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TfamP40630 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TfamP40630 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TfamP40630 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TfamP40630 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TfamP40630 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TfamP40630 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TfamP40630 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TfamP40630 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TfamP40630 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TfamP40630 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TfamP40630 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TfamP40630 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TfamP40630 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TfamP40630 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TfamP40630 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TfamP40630 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TfamP40630 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TfamP40630 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TfamP40630 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TfamP40630 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TfamP40630 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TfamP40630 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TfamP40630 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TfamP40630 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TfamP40630 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TfamP40630 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TfamP40630 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TfamP40630 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TfamP40630 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TfamP40630 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TfamP40630 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TfamP40630 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TfamP40630 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TfamP40630 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TfamP40630 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TfamP40630 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TfamP40630 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TfamP40630 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TfamP40630 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TfamP40630 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TfamP40630 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TfamP40630 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TfamP40630 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TfamP40630 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TfamP40630 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TfamP40630 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TfamP40630 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms