Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upk2P38575 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upk2P38575 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk2P38575 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk2P38575 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk2P38575 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk2P38575 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk2P38575 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk2P38575 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk2P38575 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk2P38575 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk2P38575 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upk2P38575 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.2 ms