Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Lamc1P02468 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lamc1P02468 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms