Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52l1O54818 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms