Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITM2AO43736 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITM2AO43736 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms