Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Srsf5O35326 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srsf5O35326 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srsf5O35326 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srsf5O35326 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srsf5O35326 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srsf5O35326 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srsf5O35326 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srsf5O35326 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srsf5O35326 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srsf5O35326 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srsf5O35326 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srsf5O35326 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srsf5O35326 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srsf5O35326 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srsf5O35326 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srsf5O35326 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srsf5O35326 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srsf5O35326 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms