Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cldn34c3J3QJW5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cldn34c3J3QJW5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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