Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gm8247F6VRJ8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gm8247F6VRJ8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gm8247F6VRJ8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm8247F6VRJ8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm8247F6VRJ8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm8247F6VRJ8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm8247F6VRJ8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Gm8247F6VRJ8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Gm8247F6VRJ8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Gm8247F6VRJ8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Gm8247F6VRJ8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Gm8247F6VRJ8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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Gm8247F6VRJ8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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