Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms