Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc78D3Z5T1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc78D3Z5T1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms