Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp42B2RQC2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms