Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms