Protein–RNA interactions for Protein: A2AMD2

Ankrd60, Ankyrin repeat domain 60, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd60A2AMD2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd60A2AMD2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd60A2AMD2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd60A2AMD2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd60A2AMD2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd60A2AMD2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd60A2AMD2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd60A2AMD2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd60A2AMD2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd60A2AMD2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd60A2AMD2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd60A2AMD2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd60A2AMD2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd60A2AMD2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd60A2AMD2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd60A2AMD2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd60A2AMD2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd60A2AMD2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd60A2AMD2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd60A2AMD2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms