Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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