Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knop1Q9Z2Q2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knop1Q9Z2Q2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms