Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubl3Q9Z2M6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms