Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z126

Pf4, Platelet factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pf4Q9Z126 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pf4Q9Z126 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms