Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lhx6Q9R1R0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms