Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcea2Q9QVN7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms