Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.4 ms