Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms