Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PnkpQ9JLV6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PnkpQ9JLV6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms