Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ddx20Q9JJY4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx20Q9JJY4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms