Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms