Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc3Q9D6Y1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc3Q9D6Y1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc3Q9D6Y1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc3Q9D6Y1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc3Q9D6Y1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc3Q9D6Y1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc3Q9D6Y1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc3Q9D6Y1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc3Q9D6Y1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc3Q9D6Y1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms