Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB2

Nhp2, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhp2Q9CRB2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhp2Q9CRB2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhp2Q9CRB2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.4 ms