Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms