Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms