Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms