Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rnf17Q99MV7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms