Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ2

Abtb1, Ankyrin repeat and BTB/POZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abtb1Q99LJ2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Abtb1Q99LJ2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abtb1Q99LJ2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abtb1Q99LJ2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abtb1Q99LJ2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abtb1Q99LJ2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abtb1Q99LJ2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abtb1Q99LJ2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abtb1Q99LJ2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Abtb1Q99LJ2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abtb1Q99LJ2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abtb1Q99LJ2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abtb1Q99LJ2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abtb1Q99LJ2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abtb1Q99LJ2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abtb1Q99LJ2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abtb1Q99LJ2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abtb1Q99LJ2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abtb1Q99LJ2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abtb1Q99LJ2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abtb1Q99LJ2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.6 ms