Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TriobpQ99KW3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TriobpQ99KW3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms