Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
TOPBP1Q92547 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
TOPBP1Q92547 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms